Στο μικροσκόπιο των αστυνομικών και δικαστικών αρχών είχε μπει εδώ και αρκετό καιρό η λειτουργία των δομών της «Κιβωτού του Κόσμου», όπως προκύπτει από στοιχεία, που βλέπουν το φως της δημοσιότητας.
Σύμφωνα με ρεπορτάζ του Βασίλη Λαμπρόπουλου στην εφημερίδα «Τα Νέα», μυστική έρευνα της Εισαγγελίας Ιωαννίνων, σε συνεργασία με κοινωνικές συμβούλους της Περιφέρειας Ηπείρου, για κακοποίηση κοριτσιών στη δομή της Κόνιτσας, που είχε ξεκινήσει πριν από αρκετούς μήνες, είχε αναδείξει τα μεγάλα προβλήματα στη συγκεκριμένη ΜΚΟ, αρκετό διάστημα πριν από τη δημοσιοποίηση της υπόθεσης από την έρευνα της ΕΛ.ΑΣ.